自建房有房产证不能过户的情况：
1、被法院或执法部门查封的房产。 如果你的房子因为特殊原因被查封过，那个房子你就不能随意处置了，因为本来就是不安全的，购房者是不会轻易购买的。
2、有抵押登记的房产。 一般来说，其实首先，未还清贷款的二手房在实际操作中是可以买卖的，但要在前期做好相应的工作。有房贷在身，肯定需要你想办法把房贷还清，这个时候可以申请担保单位。那假如买方的首付款刚好能覆盖我们剩下的房贷，那我们用买方的首付款来还清剩余的房贷，先办贷款结清证明，然后到房产交易中心办理解除抵押登记手续，然后再进行下一步的买卖交易。
3、房产证未满五年的经济适用房。 一般经济适用房会有过户年限的要求，没有到这个时间是不能过户的，经济适用房就是这样。
4、部分安置房 安置房也是商品房，但是有些安置房是要几年后才能上市交易的，有些安置房只要到手就可以交易，这要分情况来看。
5、小产权房 现行法律法规明确，世界上普遍实施土地用管制，所以“小产权房”不会被予以登记。小产权房本就不是被法律承认的，也是不允许买卖的，所以自然是不允许过户的。但是实际上很多人在私底下过户，但小产权房一旦因房屋遇到纠纷、法院往往不予受理。
南通房产买卖过户手续：
1、出售咨询；
出售双方可以进行沟通，卖方把身份证、房产证以及其它相关证件准备最好，买方要对于房间的产权和具体情况进行了解。
2、实地看房子；
出售双方确定最好一个时间，然后到实地去看房，买方会按照自己的需求，对于房间情况、旁边环境、小区情况等进行考察。还会查询卖方提供的相关证件，明确自己的购买意向。
3、签订合同；
如果买方确定购买的情况下有，双方就可以进行出售合同签订。双方经过协商，对于房间的位置、产权情况、成交费用、交付时间、产权办理等协商一致以后，买方给卖方支付首付款，签订一式三份的出售合同。
4、签订贷款合同；
买方提供身份证、收入证明、出售合同、担保书等资料提交给银行，然后银行和买方签订抵押贷款合同，办理房产抵押登记和公证，在约定的时间内把资金划入买方账户。
5、缴税过户；
双方向房地产相关部门指出过户申请，根据相关规范进行缴费契税、个税、增值税等税费。相关部门接受申请，检验相关证件，如果符合流程的话才能申办过户手续，不符合会被拒绝申请，以后就阻止出售。
6、领取房产证；
双方办理产权变更登记以后，资料会被提交到发证部门，买方可以凭通知单到发证部门领取新的房产证。
