二手商铺办理房产证需要的费用有：
1、增值税=（卖出价—买进价）*5.5%；
2、合同印花税=卖出价*0.05%；
3、土地增值税=增值额*适用税率—抵扣项合计*抵扣系数（此处适用税率和抵扣系数详见附件）
1）增值额=卖出价—买进价—买进契税—本次交易的营业税—其他抵扣（买进价*5%*买进年数）；
2）抵扣项合计=买进价买进契税 本次交易的营业税 其他抵扣；
3）增值率=增值额/抵扣项合计*100%；
非普通住宅契税要加倍。无论取得产权满不满两年。普通住宅不满5年（含）转让的，按销售价减去房屋成本价缴纳营业税，满5年免缴。非普通住宅不满5年（含）转让的，按销售价缴纳全额营业税，满5年以上转让的，按销售价减去房屋成本价缴纳营业税。
房屋抵押手续流程：
1、房产抵押贷款办理先要贷款申请：借款人提出贷款用途，金额及年限时间。
2、准备贷款材料：借款人将贷款申请贷款所需文件、证件按要求准备齐全。
3、看房评估：房产抵押贷款由相关机构对抵押房进行实地勘查、评估。
4、报批贷款：房产抵押贷款将所有申贷资料连同评估报告或勘估意见书报送银行审批。
5、借款合同公证：房产抵押贷款办理借款人及抵押人填写(借款合同)及所有相关文件、签字、盖手印后，由公证人员对其进行公证。
6、抵押登记手续：银行凭房屋所有权证和借款合同公证书到房管部门办理抵押登记手续。
7、开户、放款：借款人开立还款账户、银行放款至该账户。
