二手商铺办理房产证需要的费用有：
1、增值税=（卖出价—买进价）*5.5%；
2、合同印花税=卖出价*0.05%；
3、土地增值税=增值额*适用税率—抵扣项合计*抵扣系数（此处适用税率和抵扣系数详见附件）
1）增值额=卖出价—买进价—买进契税—本次交易的营业税—其他抵扣（买进价*5%*买进年数）；
2）抵扣项合计=买进价买进契税 本次交易的营业税 其他抵扣；
3）增值率=增值额/抵扣项合计*100%；
非普通住宅契税要加倍。无论取得产权满不满两年。普通住宅不满5年（含）转让的，按销售价减去房屋成本价缴纳营业税，满5年免缴。非普通住宅不满5年（含）转让的，按销售价缴纳全额营业税，满5年以上转让的，按销售价减去房屋成本价缴纳营业税。
杭州房屋赠予与买卖过户哪个划算，还要看具体情况：
一、赠与过户：适用于房产持有没有超过五年的情况；
父母在世时，通过赠与的方式，把房产过户给子女。父母将房产赠与给子女时，需缴纳以下三种税费：以房产评估值为计税基础，契税按3%，公证费按1%，评估费按0.25%，三项税费加起来4.25%。根据《财政部 国家税务总局关于个人无偿受赠房屋有关个人所得税问题的通知》（财税〔2009〕78号）第一条规定，符合以下情形的，对当事双方不征收个人所得税：
（一）房屋产权所有人将房屋产权无偿赠与配偶、父母、子女、祖父母、外祖父母、孙子女、外孙子女、兄弟姐妹；
（二）房屋产权所有人将房屋产权无偿赠与对其承担直接抚养或者赡养义务的抚养人或者赡养人；
（三）房屋产权所有人死亡，依法取得房屋产权的法定继承人、遗嘱继承人或者受遗赠人。
简单来说，就是父母将房产赠与过户免征个税。
二、买卖过户：适用于房产超过了五年的情况；
父母在世时，把房子以买卖的方式给子女，实现过户。一般，通过买卖方式实现房屋过户，主要费用有三种：契税、增值税、个税。
（1）契税一般按照1.5%计算，特殊情况：房子是满五唯一：1%-3%的契税。(契税比例按普通非普通、唯一非唯一而定)；满五唯一普通住宅且子女无房产：仅需缴纳1%的契税。
（2）增值税，房产证不满两年的按照5.6%计算，满了两年的免交增值税。
（3）个税，非普通住宅交易总价格的2%，一般普通住宅是总价的1%。
