二手商铺办理房产证需要的费用有：
1、增值税=（卖出价—买进价）*5.5%；
2、合同印花税=卖出价*0.05%；
3、土地增值税=增值额*适用税率—抵扣项合计*抵扣系数（此处适用税率和抵扣系数详见附件）
1）增值额=卖出价—买进价—买进契税—本次交易的营业税—其他抵扣（买进价*5%*买进年数）；
2）抵扣项合计=买进价买进契税 本次交易的营业税 其他抵扣；
3）增值率=增值额/抵扣项合计*100%；
非普通住宅契税要加倍。无论取得产权满不满两年。普通住宅不满5年（含）转让的，按销售价减去房屋成本价缴纳营业税，满5年免缴。非普通住宅不满5年（含）转让的，按销售价缴纳全额营业税，满5年以上转让的，按销售价减去房屋成本价缴纳营业税。
