父亲过户给儿子房子方式不一样费用也不一样，要根据具体情况来确定过户方式和过户费用：
一、继承过户，继承过户要在产权人过世以后办理，不需要缴纳税费，只需要房产评估费，过户费，产权登记等费用；
二、赠与过户，赠与过户需要缴纳3%的房产评估价格的契税，过户服务费，房产评估费，产权登记费等费用；
三、买卖过户，1、契税，如果买家是首套房产面积在90平一下的，是房本价格的1%，如果买家是首套面积在90-144平米的，是房本价格的1.5%，如果买家是首套房产面积在144平米以上的或者二套及以上的，都是房本价格的3%；印花税，房本价格的0.1%；过户服务费：6元/平方米；产权登记费：几十元。买卖过户可以身亲税费减免，交税可以按照房本价交。
父亲过户给儿子房子需要的费用：
1、赠与过户：个税和增值税免征，缴纳契税3%，这种过户方式适合不满五年的房屋；
2、买卖过户：个税1%或者差价的20%（满五唯一免征），增值税5.6%（满五年免征），契税1%-3%；
3、继承过户：公证费、评估费和工本费，无需交税费，这种方式必须在父亲过世后才能过户。
父亲过户给儿子房子有是那种情况，分别的费用也不同：
一、买卖过户，也就是以买卖的方式按照交易的程序去办理过户。房屋买卖办理过户的主要费用有营业税、个人所得税和契税三种。其中房产满5年，营业税是免征的，同时个税也免征，只需要缴纳契税和产权转移登记费，如果房产未满5年，需要缴纳营业税和个税，同时缴纳契税和产权转移登记费。
二、以赠与的方式办理过户，先办理赠与公证，然后办理房屋评估作价和房屋鉴定，最后办理过户。办理赠与过户，需要缴纳个人所得税、契税和公证费。赠与过户是没有营业税的，因为赠与被认为是无偿受赠的行为，所以需要受赠人缴纳个人所得税，同时赠与过户也需要缴纳公证费。
三、以继承的方式办理过户，但这种情况需要发生在父母一方死亡的情况下，不是很常用。继承过户与买卖和赠与相比，税费支出是较低的，因为继承的房产没有营业税、个税和契税，只需要缴纳公证费。
父亲过户给儿子房子需要办理的手续费：
赠与过户只需要缴纳契税3%；
买卖过户缴纳个税1%或者差价的20%（满五唯一免征），增值税5.6%（满五年免征），契税1%-3%（首套且90㎡以内1%，144㎡以内1.5%，超出144㎡或者二套房3%）；继承过户缴纳公证费2%，评估费6元/㎡，还有工本费痛。
《民法典》中则对继承方面的问题加以了修正和完善，深圳房产直系亲属过户有了新规定：
1.可以代位继承。比如，小张从小是孤儿，小叔也没有妻儿，小张就跟小叔相依为命，为小叔养老送终后，小张是可以继承小叔的房产，因为根据民法典907条之规定，将被继承人的侄、甥也纳入了代位继承人范围。
2.继承宽恕制度。如，小王不孝顺父母，老人在立遗嘱时，小王被排除在继承范围之外，所谓浪子回头金不换，随着时间推移，小王能悔过自新，而这些被老人看在眼里记在心里，决定原谅小王，即把小王列入继承人，那么，小王仍旧可享有房屋继承权。
3.判定遗嘱效力。如，老人有3个儿子，在早些时候，老人立了一份遗嘱并公证，里面写明房产给3个儿子平分，但后来发现，小儿子对自己最好、照顾时间也最多，老人又立一份遗嘱，写明小儿子分2/3房产，但未经过公证，而新规在删除“公证遗嘱效力优先”的规定后，意味着遗嘱以最后一个时间为准，老人的愿望得以实现，同时还新增加了打印和录像等立遗嘱形式，其中打印遗嘱只需要有两个以上见证人，立遗嘱人和见证人在每一页签字和注明年月日时间即可。
直系亲属关系过户就是直系亲属之间的房产过户，直系亲属指的是： 父母、子女、夫妻、爷爷奶奶、外公外婆、孙子孙女、外孙外孙女等；直系亲属过户有三种方式，分别是：
一、继承房产过户： 1、遗嘱继承，产权人通过立遗嘱的方式办理房产过户的，要先进行遗嘱公证，取得继承公证书，然后继承人带上被继承人的证明和房产信息去琼海房管局办理继承过户手续； 2、法定继承，按照法定继承的方式办理继承过户，不需要办理继承公证，但是需要继承人和被继承人的亲属关系证明，以及其他继承人的放弃继承的证明，去房管局申请继承过户，房管局会对房屋进行评估，给出房屋的具体信息，审核继承人、被继承人的资料通过后就可以办理过户手续。
二、赠与房产过户： 1、签订赠与协议书，去公证处办理赠与公证；2、提交资料给到房管局；3、房管局审核资料，评估房产，测绘房屋，给出房产的税费清单；4、受赠双方缴纳税费，领取税费证明；5、办理过户手续；6、领取新的房产证。
三、直系亲属买卖过户： 1、签订二手房买卖合同，办理网签；2、递件，提交资料给到不动产登记中心审核；3、缴费，按照不动产登记中心审核评估意见，缴纳相关税费；4、办理过户手续；5、领取新证。
